More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2913 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  84.85 
 
 		 398 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 398 aa  817    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  83.88 
 
 		 397 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  90.43 
 
 		 399 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  80.9 
 
 		 398 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  81.12 
 
 		 397 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  76.77 
 
 		 398 aa  624  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  60.51 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  61.21 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  62.34 
 
 		 398 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  61.28 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  59.32 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  58.53 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  58.53 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  57.74 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  57.66 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  57.74 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  51.02 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  51.02 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  52.17 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  51.02 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  54.97 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  54.19 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  53.93 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  56.65 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  53.39 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  55.85 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  55.58 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  50.38 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  50.25 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  56.35 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  50.9 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  54.29 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  52.54 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  54.03 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  52.73 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  51.54 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  51.94 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  51.53 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  52.63 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  51.94 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  51.94 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  51.94 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  51.15 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  51.68 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  47.81 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  53.54 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  54.29 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  52.03 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  49.36 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  49.61 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  50.52 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  50.52 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  49.23 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  48.85 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  50.78 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  48.71 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  53.33 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  49.62 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 		 418 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  47.8 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  47.55 
 
 		 395 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  47.8 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  47.8 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  47.8 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  46.25 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  342  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  47.75 
 
 		 388 aa  338  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  46.04 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  47.38 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  45.95 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  45.52 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  47.67 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  47.19 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  45.08 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  46.39 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  45.25 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  46.7 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  47.41 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  43.73 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0540  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.144132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  46.39 
 
 		 401 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>