More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1980 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  100 
 
 
407 aa  837    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  48.83 
 
 
400 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  46.91 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  46.61 
 
 
394 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
394 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  47.4 
 
 
394 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  47.79 
 
 
394 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  47.14 
 
 
403 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  47.66 
 
 
394 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  47.4 
 
 
393 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  47.4 
 
 
393 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  47.4 
 
 
393 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
469 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  46.61 
 
 
403 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  48 
 
 
417 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
394 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  49.09 
 
 
393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  47.29 
 
 
393 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  47.66 
 
 
404 aa  346  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  47.01 
 
 
389 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  44.15 
 
 
431 aa  338  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  46.63 
 
 
392 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  45.43 
 
 
389 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  45.43 
 
 
453 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 
398 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  46.55 
 
 
397 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  50.14 
 
 
418 aa  328  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  46.67 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  47 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 
398 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  45.25 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  45.55 
 
 
469 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  45.81 
 
 
388 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  47.11 
 
 
388 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  44.68 
 
 
392 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  44.82 
 
 
399 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 
395 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 
395 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  44.39 
 
 
416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 
415 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 
399 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 
393 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 
393 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  45.21 
 
 
391 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 
393 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  44.21 
 
 
407 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  47.49 
 
 
401 aa  315  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  44.38 
 
 
411 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  43.9 
 
 
395 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  44.66 
 
 
407 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  39.44 
 
 
397 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  43.23 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 
393 aa  310  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 
398 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  44.66 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  42.04 
 
 
395 aa  309  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 
396 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  43.7 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  43.47 
 
 
397 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  42.27 
 
 
415 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  44.69 
 
 
399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  43.56 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  41.84 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  42.75 
 
 
396 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  42.56 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  43.31 
 
 
397 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 
395 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  43.29 
 
 
399 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  43.56 
 
 
399 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  43.29 
 
 
399 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 
397 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  43.31 
 
 
395 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  43.29 
 
 
399 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  44.23 
 
 
395 aa  299  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 
389 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  42.12 
 
 
393 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  45.33 
 
 
400 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
396 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  43.29 
 
 
399 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  45.74 
 
 
398 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  41.6 
 
 
388 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.54 
 
 
399 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  41.64 
 
 
396 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  43.97 
 
 
388 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.97 
 
 
426 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>