More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4431 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 		 407 aa  827    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  47.64 
 
 		 415 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  44.85 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  44.21 
 
 		 407 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  46.11 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  44.67 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  44.36 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  44.7 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  43.36 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 396 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  41.98 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  44.02 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 389 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 		 398 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  42.42 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  44.59 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  42.97 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  40.69 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  42.25 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  40.65 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  41.28 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5109  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.78 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  42.3 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  42.21 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  41.54 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  42.04 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.57 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  43.22 
 
 		 418 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  40.46 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  41.33 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  40.67 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  42.24 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  41.42 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  40.51 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  41.64 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  41.51 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  38.6 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  41.32 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  40.3 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  41.47 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  40.3 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  39.53 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  43.07 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  41.32 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  40.42 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  37.18 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1495  cystathionine beta-lyase  40.47 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  37.94 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  37.23 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  38.56 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  40.25 
 
 		 416 aa  255  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.44 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  38.44 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  37.02 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  37.8 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  38.4 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  36.2 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  41.79 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  36.1 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  38.58 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  36.98 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  37.37 
 
 		 393 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  38.25 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  38.44 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  35.81 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  42.05 
 
 		 396 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  37.37 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  38.05 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  37.98 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>