More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2413 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 415 aa  850    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  47.93 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  49.21 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  48.72 
 
 		 400 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  49.86 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  49.22 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  49.22 
 
 		 395 aa  346  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  47.92 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  342  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  48.7 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  46.91 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  47.06 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  48.6 
 
 		 397 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  46.21 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  48.6 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  45.74 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  47.26 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  47.52 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  42.46 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  48.06 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  45.57 
 
 		 399 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  45.25 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  46.75 
 
 		 397 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  47.29 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  44.09 
 
 		 389 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  43.64 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  45.69 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  42.6 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  43.83 
 
 		 389 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  40.69 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  45.19 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  43.57 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  44.94 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  41.54 
 
 		 407 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  43.11 
 
 		 399 aa  312  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  43.48 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  44.22 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1495  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 395 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  44.22 
 
 		 418 aa  309  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 399 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  41.33 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  40.51 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  46.49 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  42.27 
 
 		 407 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  43.44 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  40.86 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  40.86 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  40.86 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  40.86 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  40.97 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  40.97 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  41.26 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  40.97 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  42.64 
 
 		 397 aa  300  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  40.71 
 
 		 395 aa  298  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  40.41 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  42.17 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  39.44 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  39.49 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  39.49 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  39.49 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  44.05 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  40.2 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 400 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 416 aa  292  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  41.12 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  39.39 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  43.06 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>