More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3762 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  89.92 
 
 
397 aa  734    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  81.73 
 
 
396 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  77.41 
 
 
398 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  81.98 
 
 
396 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  100 
 
 
397 aa  823    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  73.6 
 
 
395 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  73.6 
 
 
395 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  73.6 
 
 
395 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  73.1 
 
 
395 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  72.84 
 
 
395 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  73.35 
 
 
395 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  72.84 
 
 
440 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  73.1 
 
 
395 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  73.1 
 
 
395 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  71.57 
 
 
395 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  71.83 
 
 
395 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  71.57 
 
 
395 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  71.57 
 
 
395 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  72.19 
 
 
403 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  72.19 
 
 
403 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  72.19 
 
 
403 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  71.07 
 
 
395 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  71.32 
 
 
395 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0540  cystathionine beta-lyase  70.45 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.144132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  67.79 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  62.03 
 
 
401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  61.27 
 
 
402 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  61.27 
 
 
396 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  61.93 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  58.02 
 
 
393 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  57.91 
 
 
391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  56.49 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  57.8 
 
 
411 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  57.58 
 
 
395 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  55.36 
 
 
407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  56.06 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  55.81 
 
 
399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  55.81 
 
 
399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  55.61 
 
 
395 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  55.56 
 
 
399 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  54.96 
 
 
401 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  55.78 
 
 
399 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  55.56 
 
 
399 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  55.88 
 
 
396 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  55.53 
 
 
399 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  55.53 
 
 
399 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  55.01 
 
 
399 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  48.09 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  48.37 
 
 
400 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  50.25 
 
 
398 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  47.57 
 
 
398 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  45.38 
 
 
418 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 
393 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  47.67 
 
 
398 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 
393 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  45.43 
 
 
398 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 
397 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  46.77 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 
393 aa  328  8e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  47.41 
 
 
397 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 
389 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  45.78 
 
 
395 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  45.64 
 
 
388 aa  322  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  46.04 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  46.11 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  44.25 
 
 
469 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 
389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  45.34 
 
 
453 aa  319  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  44.64 
 
 
388 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  45.09 
 
 
392 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  42.31 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  44.19 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  44.19 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  44.1 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  44.99 
 
 
396 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 
389 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  44.85 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  42.64 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 
396 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 
393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  45.01 
 
 
395 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  40.36 
 
 
389 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  42.17 
 
 
415 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  42.45 
 
 
395 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  41.88 
 
 
397 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 
388 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  41.81 
 
 
418 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
388 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 
412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 
388 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
400 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 
400 aa  279  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  40.46 
 
 
388 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  39.9 
 
 
405 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  40.76 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3936  cystathionine beta-lyase  40.2 
 
 
388 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>