More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3976 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  86.25 
 
 		 400 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 400 aa  815    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  76.36 
 
 		 412 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  75.84 
 
 		 405 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  59.16 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  56.51 
 
 		 931 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 		 896 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  55.36 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  54.57 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1392  cystathionine beta-lyase  46.74 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000072786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0279  cystathionase beta-lyase  47.14 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0259  cystathionine beta-lyase  46.74 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1581  cystathionine beta-lyase  46.21 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.975747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1206  cystathionine beta-lyase (CBL) (Beta-cystathionase)(cysteine lyase)  46.83 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37868  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  47.01 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  51.45 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  49.35 
 
 		 407 aa  352  8.999999999999999e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  48.84 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  48.3 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  45.95 
 
 		 391 aa  342  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  45.09 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  48.07 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  45.38 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  44.59 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  47.56 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  44.94 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  47.56 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  45.29 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  44.67 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  46.46 
 
 		 395 aa  329  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  45.71 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  44.33 
 
 		 395 aa  329  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  46.72 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  43.91 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  45.66 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  46.39 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  43.72 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  43.19 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  43.47 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 		 399 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 		 399 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  44.16 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  45.34 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  43.44 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 		 399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  44.5 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  43.9 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  46.52 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  43.12 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  47.81 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  44.39 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  41.86 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  43.13 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  43 
 
 		 396 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  44.39 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  45.16 
 
 		 395 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 403 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 403 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 403 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  42.39 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  40.2 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  44.85 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  40.2 
 
 		 393 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  40.2 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  42.14 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  39.75 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  39.75 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  39.75 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  39.75 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3936  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  39.49 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  39.24 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  39.04 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  39.24 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 		 395 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  39.24 
 
 		 395 aa  292  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>