More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3161 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  62.15 
 
 		 931 aa  1126    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  63.14 
 
 		 530 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 896 aa  1805    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  60.46 
 
 		 551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  60.69 
 
 		 523 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  57.17 
 
 		 529 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  57.14 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  56.57 
 
 		 529 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  57.63 
 
 		 528 aa  532  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  69.45 
 
 		 388 aa  532  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  57.5 
 
 		 531 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  50.75 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  58.16 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  59.01 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  57.48 
 
 		 400 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  56.15 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  56.81 
 
 		 388 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1392  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000072786  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1581  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  355  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.975747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0259  cystathionine beta-lyase  44.18 
 
 		 387 aa  353  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0279  cystathionase beta-lyase  44.44 
 
 		 389 aa  350  6e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  51.44 
 
 		 401 aa  349  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  51.92 
 
 		 396 aa  348  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 525 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  51.18 
 
 		 393 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  48.44 
 
 		 407 aa  331  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1206  cystathionine beta-lyase (CBL) (Beta-cystathionase)(cysteine lyase)  41.84 
 
 		 387 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  42.38 
 
 		 527 aa  329  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  39.17 
 
 		 527 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  44.68 
 
 		 469 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 		 545 aa  321  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  39.41 
 
 		 527 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 533 aa  319  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.34 
 
 		 739 aa  316  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  43.23 
 
 		 396 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  44.97 
 
 		 385 aa  314  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  40.81 
 
 		 528 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  41.82 
 
 		 401 aa  310  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  41.97 
 
 		 396 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  40.24 
 
 		 533 aa  308  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  42.75 
 
 		 396 aa  308  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  45.55 
 
 		 418 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  40.88 
 
 		 535 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  40.04 
 
 		 549 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  40.04 
 
 		 549 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  39.46 
 
 		 774 aa  304  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 388 aa  303  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  40.52 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  44.62 
 
 		 398 aa  302  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 		 388 aa  302  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  41.38 
 
 		 527 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 541 aa  300  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  42.15 
 
 		 389 aa  300  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  40.47 
 
 		 393 aa  300  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 396 aa  299  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  39.85 
 
 		 396 aa  297  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 398 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  40.79 
 
 		 391 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  38.22 
 
 		 453 aa  292  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  45.31 
 
 		 388 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 555 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 541 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  43.93 
 
 		 400 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  39.79 
 
 		 389 aa  290  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 		 389 aa  289  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 		 397 aa  290  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  39.58 
 
 		 532 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  38.99 
 
 		 396 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  43.8 
 
 		 399 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 392 aa  289  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  39.16 
 
 		 406 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  44.63 
 
 		 569 aa  286  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  44.54 
 
 		 411 aa  287  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  41.86 
 
 		 397 aa  286  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  44.1 
 
 		 418 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  40.53 
 
 		 395 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  44.94 
 
 		 569 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  43.19 
 
 		 398 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  38.36 
 
 		 407 aa  284  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 401 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  41.82 
 
 		 388 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  40.12 
 
 		 568 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  40.12 
 
 		 568 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  40.08 
 
 		 541 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 528 aa  282  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  41.12 
 
 		 398 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  40.52 
 
 		 395 aa  281  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 411 aa  281  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  44.62 
 
 		 398 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  43.16 
 
 		 395 aa  280  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  37.52 
 
 		 555 aa  279  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3936  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 388 aa  279  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  41.11 
 
 		 395 aa  277  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 389 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  38.24 
 
 		 399 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  38.94 
 
 		 415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  40.85 
 
 		 397 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>