282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  63.55 
 
 
535 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  72.49 
 
 
527 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  73.24 
 
 
527 aa  786    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  79.13 
 
 
527 aa  842    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  64.95 
 
 
535 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  65.92 
 
 
541 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  68.32 
 
 
533 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  60.65 
 
 
528 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  66.92 
 
 
532 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  66.92 
 
 
568 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  65.97 
 
 
549 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  65.92 
 
 
555 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
527 aa  1050    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  66.92 
 
 
568 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  68.89 
 
 
533 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  67.35 
 
 
569 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  65.97 
 
 
549 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  77.42 
 
 
528 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  66.54 
 
 
541 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  66.11 
 
 
569 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  64.1 
 
 
541 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  61.73 
 
 
525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  51.21 
 
 
539 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  61.29 
 
 
411 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  45.28 
 
 
551 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 
774 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  46.11 
 
 
545 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  44.04 
 
 
739 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
523 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  43.49 
 
 
528 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  44.32 
 
 
555 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  43.22 
 
 
529 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 
529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  42.15 
 
 
548 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42.94 
 
 
530 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  43.17 
 
 
531 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.07 
 
 
538 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  42.21 
 
 
931 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 
896 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
526 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
380 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.24 
 
 
361 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  38.42 
 
 
521 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.43 
 
 
549 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
220 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  27.94 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
617 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.88 
 
 
265 aa  65.1  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.33 
 
 
247 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 
389 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.11 
 
 
388 aa  63.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.92 
 
 
363 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  29.02 
 
 
388 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  23.42 
 
 
432 aa  61.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 
467 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  42.11 
 
 
116 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
470 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
125 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.42 
 
 
119 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  32.04 
 
 
456 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  27.78 
 
 
124 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40 
 
 
124 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.96 
 
 
393 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  26.46 
 
 
230 aa  54.7  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40 
 
 
124 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  27.66 
 
 
455 aa  54.3  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 
127 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 
137 aa  53.9  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.85 
 
 
124 aa  53.9  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  32.26 
 
 
99 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.52 
 
 
627 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
116 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 
480 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.71 
 
 
126 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.26 
 
 
361 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  23.57 
 
 
406 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.53 
 
 
163 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
103 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
461 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  32.91 
 
 
124 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.86 
 
 
380 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
204 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
138 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>