215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2405 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
538 aa  1082    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  60.76 
 
 
523 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  58.72 
 
 
551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  58.57 
 
 
529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  58.38 
 
 
530 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  58 
 
 
529 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  56.36 
 
 
931 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  59.43 
 
 
531 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  57.12 
 
 
528 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  57.33 
 
 
896 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  49.81 
 
 
548 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
526 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  43.1 
 
 
527 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  41.13 
 
 
527 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  43.47 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  43.47 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  42.66 
 
 
535 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  42.54 
 
 
525 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  42.07 
 
 
533 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  41.17 
 
 
527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  40.95 
 
 
528 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  42.07 
 
 
535 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.26 
 
 
545 aa  329  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  41.54 
 
 
533 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  40.33 
 
 
532 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  42.06 
 
 
527 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 
569 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  42.91 
 
 
541 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.34 
 
 
539 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 
555 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.93 
 
 
541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
528 aa  306  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  41.68 
 
 
568 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  41.68 
 
 
568 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 
774 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  41.29 
 
 
569 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  41.68 
 
 
541 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.08 
 
 
739 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  45.08 
 
 
411 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  40.73 
 
 
555 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
380 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  37.43 
 
 
521 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  38.12 
 
 
361 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.38 
 
 
549 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  24.53 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  35 
 
 
124 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 
124 aa  70.5  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25 
 
 
247 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  33.05 
 
 
119 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 
119 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 
119 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  21.99 
 
 
377 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
220 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
125 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  28.65 
 
 
279 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  21 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.84 
 
 
116 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.69 
 
 
123 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 
185 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.48 
 
 
123 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.67 
 
 
132 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.11 
 
 
389 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
617 aa  54.3  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.94 
 
 
361 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.26 
 
 
388 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
129 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 
140 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.04 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.78 
 
 
265 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  32.82 
 
 
192 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
141 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
161 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 
216 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  27.5 
 
 
137 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.41 
 
 
128 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 
103 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 
128 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  21.65 
 
 
252 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  37.08 
 
 
137 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  31.53 
 
 
119 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  30.36 
 
 
135 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.83 
 
 
141 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
129 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  38.46 
 
 
288 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>