278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3602 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  94.12 
 
 		 527 aa  1008    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  61.32 
 
 		 535 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  75.14 
 
 		 527 aa  806    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  100 
 
 		 527 aa  1067    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  66.03 
 
 		 535 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  72.68 
 
 		 528 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  67.24 
 
 		 533 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  66.86 
 
 		 533 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  64.14 
 
 		 532 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 		 549 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  73.24 
 
 		 527 aa  747    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 		 549 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  62.88 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  59.54 
 
 		 528 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  62.69 
 
 		 541 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  62.59 
 
 		 541 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  64.77 
 
 		 569 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  62.69 
 
 		 568 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  62.69 
 
 		 568 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  62.76 
 
 		 569 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  62.5 
 
 		 541 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  60.54 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  49.03 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  43.19 
 
 		 774 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.08 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.93 
 
 		 739 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 523 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  42.72 
 
 		 548 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  43 
 
 		 529 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  42.77 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  42.97 
 
 		 528 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.15 
 
 		 931 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  41.83 
 
 		 531 aa  339  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  41.94 
 
 		 555 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  41.13 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  41.02 
 
 		 530 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 526 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  39.36 
 
 		 896 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.86 
 
 		 380 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.77 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  29.78 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 		 617 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  24.76 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.02 
 
 		 216 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  24.09 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  23.88 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  27.46 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 265 aa  62  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.96 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  25.5 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  27.44 
 
 		 480 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.21 
 
 		 163 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  22.86 
 
 		 352 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.8 
 
 		 126 aa  53.9  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.79 
 
 		 361 aa  53.9  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 185 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.93 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 454 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  53.9  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 103 aa  53.9  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 380 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.52 
 
 		 252 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.81 
 
 		 123 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  27.74 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 116 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  28.35 
 
 		 272 aa  52  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  24.45 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.08 
 
 		 388 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  30 
 
 		 159 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.53 
 
 		 116 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 459 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.24 
 
 		 120 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  24.72 
 
 		 99 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 129 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  25.41 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  34.09 
 
 		 113 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.27 
 
 		 386 aa  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 284 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 119 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.11 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 119 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 126 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>