More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1275 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  523  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.51 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 		 130 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.84 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.07 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.42 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.5 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  40.82 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.59 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.85 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  28.14 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  37.11 
 
 		 703 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  37.11 
 
 		 703 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.62 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.75 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 119 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 476 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  36.7 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  35.92 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  26.24 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 102 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 121 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  24.77 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2657  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.78 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  32.79 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.71 
 
 		 711 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.76 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  39.76 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.76 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  39.76 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.76 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.76 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 617 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  39.51 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.29 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  27 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.48 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.55 
 
 		 554 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  26.22 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  41 
 
 		 105 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  27.4 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.27 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  27.92 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.45 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  22.86 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  36.11 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2650  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.846466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.52 
 
 		 711 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.74 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.44 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  31.4 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  31.4 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>