More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4079 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  37.86 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  33.98 
 
 		 761 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  38.61 
 
 		 389 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.85 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  28.68 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.71 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.87 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.65 
 
 		 398 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.48 
 
 		 386 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  35.87 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.53 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.33 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  53.49 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 771 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  35.16 
 
 		 778 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 466 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.68 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  32.43 
 
 		 753 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 		 460 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  37.23 
 
 		 363 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.56 
 
 		 393 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1937  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.336442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.27 
 
 		 392 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  36.71 
 
 		 759 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1902  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705637  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49253  predicted protein  35.42 
 
 		 566 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.836677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 		 392 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.43 
 
 		 383 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.04 
 
 		 390 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  32.29 
 
 		 198 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  34.02 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.63 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.57 
 
 		 386 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  34.02 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 		 562 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.13 
 
 		 386 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  33.7 
 
 		 565 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.59 
 
 		 386 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1054  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.53 
 
 		 564 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000017459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  25.71 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.52 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 		 550 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.69 
 
 		 393 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  25.76 
 
 		 393 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.08 
 
 		 711 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  33.6 
 
 		 820 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40 
 
 		 566 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40 
 
 		 566 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 		 566 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 472 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  27.62 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  32.63 
 
 		 711 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.71 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  36.19 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.73 
 
 		 390 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.16 
 
 		 392 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.4 
 
 		 383 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.38 
 
 		 399 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2484  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 463 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  32.58 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  28.12 
 
 		 379 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.69 
 
 		 566 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>