More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1902 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1902  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.51 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.06 
 
 		 566 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.37 
 
 		 817 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  38.54 
 
 		 567 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1937  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.336442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.97 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.33 
 
 		 551 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.96 
 
 		 567 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1394  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.47 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.54 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  43.66 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.47 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.47 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  39.47 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.47 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3727  NADH dehydrogenase  43.84 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490783  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.14 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  39.47 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.47 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36.78 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2786  rhodanese-like protein  49.18 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0518115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.47 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.44 
 
 		 548 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.04 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1430  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.54 
 
 		 569 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.06 
 
 		 831 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  37.36 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 558 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  42.86 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.64 
 
 		 395 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  45.33 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 		 375 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 368 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.13 
 
 		 561 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  41.89 
 
 		 368 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  31.9 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.26 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  39.76 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  29.91 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.97 
 
 		 548 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.97 
 
 		 548 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0058857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 388 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 278 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2756  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.97 
 
 		 548 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394023  normal  0.393296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  41.89 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  39.24 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 		 564 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  29.21 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 470 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 		 461 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 257 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.89 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.03 
 
 		 560 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  39.19 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.18 
 
 		 817 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.52 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  28.28 
 
 		 423 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  34.09 
 
 		 379 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  38.16 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  37.33 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.04 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16570  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.73 
 
 		 563 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0975833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  35.96 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>