More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1317 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  70.87 
 
 
103 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  70.87 
 
 
103 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 
104 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  47 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  44.44 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  43.43 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  43.43 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  35.87 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.96 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  38.54 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  38.54 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.36 
 
 
392 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  35.48 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 
460 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  38.83 
 
 
378 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  41.25 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  34.88 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  45.21 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  34.26 
 
 
409 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  37.25 
 
 
388 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.9 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  49.3 
 
 
354 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 
354 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 
354 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
108 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.56 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.79 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.86 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  42.86 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  38.83 
 
 
423 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.63 
 
 
390 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.93 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  35 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  35 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  39.73 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  35 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  34 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
269 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  36.89 
 
 
390 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.36 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  33.68 
 
 
288 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 
390 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  34.74 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
99 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.59 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.59 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.78 
 
 
472 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
216 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
278 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>