235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1937 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1937  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  278  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.336442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2786  rhodanese-like protein  32 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0518115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  40.22 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1902  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40.21 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.36 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.99 
 
 		 355 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.24 
 
 		 566 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 		 567 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 460 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  39.02 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.8 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 450 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 		 461 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.15 
 
 		 831 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.44 
 
 		 569 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 548 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  35.37 
 
 		 567 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  28.04 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  38.27 
 
 		 453 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 		 453 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 		 453 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.07 
 
 		 392 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.12 
 
 		 938 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3727  NADH dehydrogenase  34.41 
 
 		 550 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490783  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.25 
 
 		 386 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  32.11 
 
 		 554 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.96 
 
 		 550 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.27 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.85 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1430  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.44 
 
 		 569 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  41.27 
 
 		 554 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  41.27 
 
 		 554 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 		 567 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  29.35 
 
 		 379 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  41.27 
 
 		 554 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.61 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0176  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.14 
 
 		 569 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1394  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 558 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  29.21 
 
 		 565 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 378 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.09 
 
 		 820 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 221 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.68 
 
 		 554 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16570  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.25 
 
 		 563 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0975833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  39.68 
 
 		 554 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.41 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  39.68 
 
 		 554 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  29 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.44 
 
 		 395 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.15 
 
 		 564 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.31 
 
 		 581 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  26.53 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.56 
 
 		 568 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  27.59 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.71 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 375 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2271  Rhodanese domain protein  30.34 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  32.95 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49253  predicted protein  28.69 
 
 		 566 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.836677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.86 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>