More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2058 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 388 aa  791    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  47.32 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  36.02 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  32.93 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  26.65 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  29.39 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  28.99 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  36.41 
 
 		 230 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.74 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.07 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  28.22 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.84 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  24.12 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 122 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2786  rhodanese-like protein  38.04 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0518115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.63 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.74 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.25 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  44.44 
 
 		 567 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.57 
 
 		 142 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  42.25 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  25.36 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  25.59 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  24.77 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  24.77 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.28 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  26.84 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  28.72 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40 
 
 		 820 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  27.46 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  42.25 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.68 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.73 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  35.38 
 
 		 116 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  40.58 
 
 		 129 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 145 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  35.53 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  26.72 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.8 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  38.36 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  21.88 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  21.88 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  27.32 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  40.58 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1394  rhodanese domain-containing protein  46.03 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  21.88 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  39.39 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1430  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.03 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.88 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49253  predicted protein  36.9 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.836677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  38.67 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  25.44 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  23.78 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.48 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 150 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3727  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490783  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.88 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.88 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.39 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  24.16 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>