More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1861 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 454 aa  915    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  90.87 
 
 		 230 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2356  hypothetical protein  92.96 
 
 		 204 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  36.36 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  34.28 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  36.02 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 363 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  28.27 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.14 
 
 		 247 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  31.22 
 
 		 252 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  27.23 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.77 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  42.53 
 
 		 567 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  34 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  34 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  34 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  34 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  32 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.24 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 		 817 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  27.17 
 
 		 218 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  24.7 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  27.07 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.37 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  28.1 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  44.12 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.21 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 		 831 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  27.62 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.21 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  26.22 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  22.38 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  27.14 
 
 		 568 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 		 568 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.51 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.24 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  25.62 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.78 
 
 		 817 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3727  NADH dehydrogenase  39.71 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490783  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3629  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0836  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.77 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0587  rhodanese domain-containing protein  26.24 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287178  normal  0.0572789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1430  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.21 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.47 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1394  rhodanese domain-containing protein  45.21 
 
 		 136 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  27.4 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 113 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.62 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  27.63 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  25.77 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  27.64 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 119 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49253  predicted protein  39.29 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.836677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.91 
 
 		 820 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  27.4 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 108 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  33.7 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 105 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  29.59 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>