268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1549 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  66.86 
 
 
527 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  67.05 
 
 
527 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 
569 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  64.86 
 
 
535 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  68.72 
 
 
535 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  91.74 
 
 
533 aa  964    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  63.03 
 
 
532 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  100 
 
 
533 aa  1070    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  70.04 
 
 
527 aa  725    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  65.36 
 
 
555 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  66.98 
 
 
527 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  65.17 
 
 
541 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  67.62 
 
 
528 aa  700    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  64.8 
 
 
568 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  64.8 
 
 
568 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  63.19 
 
 
549 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  63.19 
 
 
549 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  64.99 
 
 
569 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  64.06 
 
 
541 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  62.27 
 
 
541 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  57.36 
 
 
528 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  58.46 
 
 
525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  49.71 
 
 
539 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  61.16 
 
 
411 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  45.25 
 
 
774 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
739 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.89 
 
 
551 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43.7 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  41.71 
 
 
529 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 
529 aa  346  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  41.59 
 
 
545 aa  343  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  44.55 
 
 
555 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.83 
 
 
931 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.07 
 
 
538 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 
531 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.31 
 
 
528 aa  329  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  40.87 
 
 
530 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  42.37 
 
 
548 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.63 
 
 
896 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  35.99 
 
 
526 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 
380 aa  246  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.76 
 
 
361 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  35.15 
 
 
521 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.93 
 
 
549 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28 
 
 
247 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  27.57 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.51 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  45.1 
 
 
119 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.85 
 
 
363 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  27.08 
 
 
99 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.68 
 
 
432 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
135 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 
138 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  26.64 
 
 
230 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
140 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 
454 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
135 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  38.2 
 
 
137 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.2 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
140 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  25.25 
 
 
216 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
135 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
135 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  26.04 
 
 
99 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  36.78 
 
 
138 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.7 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 
388 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 
461 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  54.7  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
119 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
119 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
119 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
119 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  28.87 
 
 
115 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
455 aa  53.5  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.82 
 
 
627 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.59 
 
 
124 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 
138 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 
129 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  36.78 
 
 
136 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.92 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  37.36 
 
 
105 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  23.47 
 
 
469 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
128 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
467 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 
124 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 
129 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 
123 aa  51.6  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.97 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  30.48 
 
 
186 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  27.46 
 
 
305 aa  50.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 
113 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 
553 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  20.95 
 
 
252 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
361 aa  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 
140 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 
127 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>