181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3974 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 531 aa  1071    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  70.27 
 
 		 551 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  62.78 
 
 		 529 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  85.71 
 
 		 528 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  74.71 
 
 		 523 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  63.43 
 
 		 529 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  59.5 
 
 		 931 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  60.61 
 
 		 530 aa  586  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  59.43 
 
 		 538 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  59.7 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  51.59 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  44.89 
 
 		 526 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  43.11 
 
 		 527 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.72 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  43.41 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  42.99 
 
 		 527 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  44.23 
 
 		 549 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  44.23 
 
 		 549 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  43.03 
 
 		 528 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.18 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  42.23 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  43.16 
 
 		 533 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  42.35 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  43.12 
 
 		 527 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  43.69 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 541 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  43.79 
 
 		 568 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  43.79 
 
 		 568 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.91 
 
 		 539 aa  327  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  43.59 
 
 		 569 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 569 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.08 
 
 		 545 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 739 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  39.89 
 
 		 774 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  39.14 
 
 		 528 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  37.36 
 
 		 555 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 380 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  38.29 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.78 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.55 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.61 
 
 		 377 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.48 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.79 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.23 
 
 		 116 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.24 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 129 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.18 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.95 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  31.43 
 
 		 279 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.99 
 
 		 124 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  23.44 
 
 		 252 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.96 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.93 
 
 		 123 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.42 
 
 		 289 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  21.84 
 
 		 432 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  23 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.46 
 
 		 136 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  25.23 
 
 		 220 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25.94 
 
 		 454 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  31.93 
 
 		 119 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 140 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 140 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.24 
 
 		 189 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 140 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  32.65 
 
 		 177 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 124 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.04 
 
 		 388 aa  50.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 144 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  25.93 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 119 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  37.65 
 
 		 141 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 119 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 119 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 218 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  28.93 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 282 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 189 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 125 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 140 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 99 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  32.14 
 
 		 270 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 466 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.7 
 
 		 123 aa  47  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 113 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  26.8 
 
 		 115 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>