211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2665 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
525 aa  1045    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  60.76 
 
 
528 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  61.12 
 
 
527 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  60.54 
 
 
527 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  60.19 
 
 
527 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  59.47 
 
 
535 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  62.15 
 
 
527 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  58.46 
 
 
533 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  57.39 
 
 
535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  58.65 
 
 
549 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  58.65 
 
 
549 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  58.65 
 
 
533 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  59.58 
 
 
532 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  59.1 
 
 
541 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  54.92 
 
 
528 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  58.71 
 
 
541 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  58.52 
 
 
555 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  58.67 
 
 
568 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  58.67 
 
 
568 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  59.62 
 
 
569 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  58.94 
 
 
541 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  58.6 
 
 
569 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  52.57 
 
 
539 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  65.36 
 
 
411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  45.87 
 
 
774 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 
739 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 
545 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  44.29 
 
 
551 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  44.21 
 
 
530 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  44.57 
 
 
555 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  43.63 
 
 
529 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  42.14 
 
 
931 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  43.29 
 
 
528 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
529 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  42.72 
 
 
896 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
523 aa  336  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.03 
 
 
538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 
531 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.61 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
380 aa  232  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.47 
 
 
361 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  33.85 
 
 
521 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.3 
 
 
549 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.8 
 
 
220 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  23.25 
 
 
423 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.04 
 
 
247 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  24 
 
 
363 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
467 aa  63.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 
389 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.37 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.96 
 
 
126 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  34 
 
 
119 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 
216 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.14 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 
130 aa  54.7  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 
617 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 
471 aa  53.9  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 
185 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.97 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  24.26 
 
 
265 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  23.66 
 
 
432 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  25.94 
 
 
480 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
116 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.19 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  37.04 
 
 
175 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.9 
 
 
393 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  37.04 
 
 
175 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  37.04 
 
 
175 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 
119 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.44 
 
 
135 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  37.04 
 
 
175 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
119 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
119 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
119 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  30.68 
 
 
99 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
126 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  30.61 
 
 
456 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  34.26 
 
 
175 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.79 
 
 
116 aa  50.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.09 
 
 
124 aa  50.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.25 
 
 
123 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.8 
 
 
120 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 
138 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 
323 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
140 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.09 
 
 
124 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
144 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.97 
 
 
173 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  30.09 
 
 
140 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
119 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
140 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
143 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.56 
 
 
177 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
119 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
119 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 
153 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  31.61 
 
 
287 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  23.92 
 
 
230 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
127 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>