198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1350 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  59.35 
 
 		 527 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  59.54 
 
 		 527 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  61.79 
 
 		 527 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 528 aa  1080    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  59.58 
 
 		 528 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  61.71 
 
 		 527 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  59.85 
 
 		 535 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  59.17 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  59.17 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  59.06 
 
 		 532 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  57.36 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  57.36 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  58.3 
 
 		 541 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  55.85 
 
 		 535 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  58.11 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  57.97 
 
 		 541 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  58.19 
 
 		 569 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  57.92 
 
 		 568 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  54.92 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  57.92 
 
 		 568 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  57.95 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  57.74 
 
 		 541 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  47.41 
 
 		 539 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  58.27 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  43.19 
 
 		 774 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 739 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  41.51 
 
 		 551 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  41 
 
 		 545 aa  342  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  40.98 
 
 		 555 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  39.03 
 
 		 529 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  39.49 
 
 		 529 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  39.41 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  37.31 
 
 		 931 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  38.49 
 
 		 523 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  38.3 
 
 		 538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  38.43 
 
 		 531 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  37.02 
 
 		 548 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  36.83 
 
 		 526 aa  287  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  36.67 
 
 		 896 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  37.43 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  37.72 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  32.68 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  28.07 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.51 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  24.39 
 
 		 216 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  32.5 
 
 		 123 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.09 
 
 		 432 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  21.36 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.5 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.83 
 
 		 123 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 124 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 123 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 138 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  26.97 
 
 		 99 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  30.25 
 
 		 119 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.23 
 
 		 388 aa  53.9  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.43 
 
 		 124 aa  53.9  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 141 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  26.97 
 
 		 99 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.28 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  28.71 
 
 		 230 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.79 
 
 		 173 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  26.47 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.71 
 
 		 126 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.37 
 
 		 133 aa  50.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 141 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 190 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  33.64 
 
 		 391 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.83 
 
 		 163 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.26 
 
 		 252 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 		 122 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 		 125 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  26.8 
 
 		 115 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  28.7 
 
 		 346 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32.65 
 
 		 142 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  25.93 
 
 		 123 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  32.18 
 
 		 138 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38 
 
 		 562 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.63 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 144 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.87 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.02 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.26 
 
 		 170 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 226 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.82 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 129 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 113 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>