220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0276 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  74.14 
 
 		 531 aa  712    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  66.79 
 
 		 551 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 523 aa  1052    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  73.3 
 
 		 528 aa  725    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  63.11 
 
 		 529 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  63.28 
 
 		 529 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  61.06 
 
 		 530 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  60 
 
 		 931 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  60.76 
 
 		 538 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  60.69 
 
 		 896 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  53.6 
 
 		 548 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  44.02 
 
 		 526 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  43.31 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.25 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  43.85 
 
 		 533 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  43.97 
 
 		 527 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  43.7 
 
 		 533 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  41.71 
 
 		 528 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 		 525 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 535 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  43.12 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 549 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 549 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  43.69 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  40.65 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  40.96 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  40.73 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  40.73 
 
 		 555 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 569 aa  316  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  41.34 
 
 		 568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  41.34 
 
 		 568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  41.09 
 
 		 774 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 		 739 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.19 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  40.67 
 
 		 569 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 		 528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 539 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  41.19 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  42.9 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.97 
 
 		 361 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 		 380 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.01 
 
 		 521 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.1 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.15 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  27.35 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 247 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.69 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 617 aa  63.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.73 
 
 		 124 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  24.14 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  28.69 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.02 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.23 
 
 		 116 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  24.33 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.52 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.95 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  21.69 
 
 		 432 aa  57  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 129 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.81 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 		 216 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.36 
 
 		 388 aa  55.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  28.41 
 
 		 99 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  22.06 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 124 aa  53.5  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.71 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.77 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  28.41 
 
 		 99 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 189 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 114 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 129 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.98 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.85 
 
 		 123 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.66 
 
 		 159 aa  51.2  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  31.91 
 
 		 123 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.81 
 
 		 123 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  30.14 
 
 		 157 aa  50.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.64 
 
 		 289 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 		 137 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 226 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  29.77 
 
 		 155 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 		 119 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  27.36 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  33.64 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 		 119 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 127 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  26.6 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 130 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 130 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  35.34 
 
 		 118 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>