138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1882 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  68.44 
 
 		 774 aa  970    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 739 aa  1448    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  52.44 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  47.49 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  44.91 
 
 		 527 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  48.41 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.92 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 545 aa  382  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 		 533 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  45.59 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 549 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 549 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  43.81 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 		 528 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  43.05 
 
 		 539 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  46.42 
 
 		 569 aa  362  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  43.95 
 
 		 555 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  40.93 
 
 		 527 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  43.76 
 
 		 541 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  40.37 
 
 		 527 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  44.53 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  44.34 
 
 		 541 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  42.15 
 
 		 569 aa  349  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 529 aa  349  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  43.87 
 
 		 527 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.45 
 
 		 529 aa  344  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  40.63 
 
 		 551 aa  342  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  40.58 
 
 		 528 aa  339  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  37.24 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 931 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.34 
 
 		 896 aa  310  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42.12 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  39.93 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  47.41 
 
 		 411 aa  301  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.45 
 
 		 548 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  40.08 
 
 		 538 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  40.04 
 
 		 531 aa  289  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 380 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.04 
 
 		 361 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  35.91 
 
 		 521 aa  211  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.75 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  41.99 
 
 		 196 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  41.88 
 
 		 223 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  43.67 
 
 		 226 aa  121  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  39.56 
 
 		 196 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  40.35 
 
 		 196 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  39.53 
 
 		 200 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  37.63 
 
 		 212 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  33.95 
 
 		 194 aa  99.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  36.63 
 
 		 197 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  39.72 
 
 		 208 aa  94.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.02 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.46 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  25.37 
 
 		 189 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 220 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.07 
 
 		 392 aa  56.6  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 470 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  26.67 
 
 		 377 aa  55.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 463 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.93 
 
 		 119 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.77 
 
 		 136 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 466 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 470 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 617 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  25.11 
 
 		 265 aa  51.2  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.5 
 
 		 395 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 102 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.31 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.3 
 
 		 189 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 141 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 		 123 aa  50.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.74 
 
 		 126 aa  48.5  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  25.22 
 
 		 455 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 118 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.92 
 
 		 252 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 218 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.63 
 
 		 393 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30 
 
 		 123 aa  48.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32.65 
 
 		 142 aa  48.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1308  putative thiosulfate sulfurtransferase  32 
 
 		 451 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.419981  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 112 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  47.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 248 aa  47.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  29.81 
 
 		 181 aa  47.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 142 aa  47.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.06 
 
 		 432 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  35.35 
 
 		 456 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.95 
 
 		 159 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 150 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 151 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 113 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.67 
 
 		 389 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>