25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1132 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  59.22 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  56.72 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  56.48 
 
 		 200 aa  211  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  51.79 
 
 		 196 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  52.33 
 
 		 197 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  46.91 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  40.88 
 
 		 195 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  44.13 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  42.46 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  43.26 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  38.15 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 739 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  37.31 
 
 		 774 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  32.68 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  30.72 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  38.38 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  36.13 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  32.33 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  27.91 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  38.75 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  28.69 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  30.23 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>