27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1885 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  67.98 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  60.62 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  59.22 
 
 		 210 aa  221  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  61.63 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  55.9 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  47 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  44.81 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  45.6 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  44.92 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  41.44 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  38.46 
 
 		 194 aa  131  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  37.91 
 
 		 774 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 739 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  33.86 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  33.6 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  27.67 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  32.74 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  27.38 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  39.74 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  35.64 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  26.6 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  25.53 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  31.13 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  26.92 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  30.43 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>