42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4624 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  436  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  59.33 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  58.85 
 
 		 211 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  54.55 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  53.59 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  52.15 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  52.63 
 
 		 203 aa  228  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  28.21 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  35.96 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  39.74 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  32.58 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  26.4 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  23.89 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  26.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  36.25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  30.34 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  22.89 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  27.61 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  24.6 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  26.99 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  27.34 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  30.14 
 
 		 774 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  31.78 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  23.2 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  29.51 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  26.88 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  26.88 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  29.13 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  25.45 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  21.43 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  23.86 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  27.46 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  25.47 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  22.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  25 
 
 		 188 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  24.65 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>