36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5773 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  64.84 
 
 		 212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  56.72 
 
 		 210 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  57.44 
 
 		 200 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  53.33 
 
 		 196 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  51.81 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  45.11 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  45.3 
 
 		 196 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  42.39 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  42.62 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  38.51 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  41.88 
 
 		 739 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 774 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  28.65 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  27.22 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  30.16 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  34.55 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  34.26 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  27.95 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  26.04 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  31.07 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  30.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  27.46 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  25.28 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  33.06 
 
 		 189 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  28.65 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  28.65 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  27.53 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  27.62 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  25.73 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  25.84 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  25.84 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  25.28 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>