24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2631 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  76.56 
 
 		 196 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  68.04 
 
 		 200 aa  280  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  61.63 
 
 		 212 aa  208  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  51.81 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  52.33 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  44.27 
 
 		 208 aa  150  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  40.34 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  44.81 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  41.28 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  40.7 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  36.84 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 739 aa  94.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 774 aa  87.8  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  40.66 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  40.24 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  37.23 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  33.33 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  35.96 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  26.71 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  25.47 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  35.8 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  37.08 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>