29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3162 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  76.56 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  67.01 
 
 		 200 aa  267  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  55.9 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  51.79 
 
 		 210 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  53.33 
 
 		 223 aa  187  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  43.75 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  45.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  43.79 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  41.28 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  42.35 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  35.84 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.35 
 
 		 739 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 774 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  28.75 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  27.63 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  33.04 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  32.58 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  25.9 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  25.3 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  30.91 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  36.78 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  28.89 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  27.17 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  28.02 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  27.91 
 
 		 171 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>