56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1475 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1475  cupin region  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  62.56 
 
 		 203 aa  275  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  61.08 
 
 		 203 aa  266  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  52.43 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  53.59 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  51.2 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  51.2 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  28.65 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  33.6 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  26.7 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  37.23 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  27.63 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  34.51 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  38.38 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  26.51 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  30.07 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  31.75 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  26.83 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  27.37 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  26.06 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  32.38 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  32.67 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  25.77 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  24.86 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 774 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  25.77 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  26.09 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  32.94 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  26.42 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  22.49 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  25 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  25.42 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  24.1 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  26.44 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  22.4 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  30.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  23.6 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  25.64 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  25.64 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  25.47 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  23.78 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  23.23 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  26.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  24.84 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  26.53 
 
 		 739 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  23.78 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  21.47 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  22.86 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  24.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  25.77 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  22.06 
 
 		 224 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  25.71 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  21.95 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  21.95 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  21.95 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>