56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0656 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  98.1 
 
 
211 aa  433  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  58.85 
 
 
209 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  49.76 
 
 
206 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  51.2 
 
 
203 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  50.72 
 
 
203 aa  204  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  48.8 
 
 
203 aa  191  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  27.54 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  26.95 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  26.71 
 
 
197 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  26.74 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  25.9 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  29.55 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  23.03 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  23.16 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  27.5 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  31.97 
 
 
143 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  31.07 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  23.91 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  21.28 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  25.16 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  25.61 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  25 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  31.86 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  27.81 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
774 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  25.88 
 
 
192 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  24.58 
 
 
196 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  23.91 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  23.78 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  23.95 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  24.84 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  24.86 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  25.85 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  26.6 
 
 
212 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  21.79 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  27.62 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  21.82 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  24.36 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  26.51 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  24.53 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  20.57 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2453  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00159574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2415  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2378  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2651  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2633  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  23.21 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 
739 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  24.71 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  24.71 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2701  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2657  hypothetical protein  27.62 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  25.32 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>