62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3973 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  87.24 
 
 		 196 aa  351  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  81.48 
 
 		 226 aa  319  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  65.98 
 
 		 195 aa  267  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  51.06 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  44.92 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  47.02 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  42.39 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  43.79 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  43.26 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  39.18 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  44.81 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 739 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 		 774 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  35.09 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  29.55 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  29.38 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  26.95 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  30.63 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  26.83 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  31.94 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  27.12 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  28.92 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  30.72 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  29.63 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  30.37 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  26.67 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  28.8 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  27.87 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  28.31 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  32.38 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  28.65 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  30.99 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  28.66 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  28.14 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  28.66 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  30.3 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  29.38 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  29.38 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  28.38 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  29.38 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  27.75 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  28.83 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  31.54 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  30.53 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  28 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  28.4 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  27.4 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  31.19 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  26.88 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  25.81 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  28.43 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  32.31 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  29.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  27.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  24.02 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  28.57 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  27.45 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  25.15 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>