66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2860 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1609  cysteine dioxygenase type I  85.33 
 
 		 222 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1753  cysteine dioxygenase type I  68.7 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2860  cysteine dioxygenase type I family protein  60 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1374  putative cysteine dioxygenase, type I  58.43 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1378  putative cysteine dioxygenase, type I  58.43 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1507  cysteine dioxygenase type I family protein  58.43 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  40.34 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  41.07 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  36.21 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1178  cysteine dioxygenase type I family protein  58.51 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0692  hypothetical protein  58.51 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347117  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  27.54 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  34.12 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  30.61 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  30.82 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  32.91 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  30.29 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  33.77 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1987  cysteine dioxygenase type I  34.53 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.935049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  31.88 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  26.52 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  26.19 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  26.52 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  26.52 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0693  cysteine dioxygenase type I  64 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0432215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  30.29 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  26.95 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  26.35 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  28.21 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  30.6 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  33.07 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  26.01 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  26.01 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1177  cysteine dioxygenase type I family protein  60.42 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.822807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  28.99 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  27.64 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  33.9 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  25.73 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  28.7 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  26.81 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  26.17 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  27.67 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  27.07 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  26.11 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  31.07 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  30.34 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04081  cysteine dioxygenase Cdo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05570)  24.26 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0171854  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2378  hypothetical protein  25.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2660  hypothetical protein  25.58 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000212284  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2633  hypothetical protein  26.36 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2651  hypothetical protein  26.36 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2415  hypothetical protein  26.36 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2453  hypothetical protein  26.36 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00159574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2701  hypothetical protein  25.58 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  29.06 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2667  hypothetical protein  24.62 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2657  hypothetical protein  23.36 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  28.93 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  26.14 
 
 		 774 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  29.76 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.277874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>