49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43654 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.277874 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04081  cysteine dioxygenase Cdo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05570)  47.47 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0171854  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  25.97 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  25.49 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  25.49 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  27.34 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  25.49 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  25.36 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  26.23 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  32.18 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  24.82 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  24.18 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  23.53 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  24.18 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  23.53 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  28.41 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  22.65 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  22.4 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  25.76 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  23.73 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  23.48 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  26.4 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1753  cysteine dioxygenase type I  32.22 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  27.21 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  23.68 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  22.88 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  27.37 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  26.72 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  25 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  24.7 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  32.95 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  22.73 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  27.61 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0873  cysteine dioxygenase type I  23.89 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  28.74 
 
 		 184 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  21.57 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2687  cysteine dioxygenase type I  28.09 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  25 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  31.76 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  22.69 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  21.8 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  22.69 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  22.69 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  29.55 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  24.35 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  27.73 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0030  cysteine dioxygenase type I  22.52 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174778  hitchhiker  0.0000000079419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  29.89 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  24.43 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>