63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5442 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  35.15 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  36.21 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1753  cysteine dioxygenase type I  41.8 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  35.8 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1609  cysteine dioxygenase type I  34.66 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2860  cysteine dioxygenase type I family protein  44.17 
 
 		 218 aa  97.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1374  putative cysteine dioxygenase, type I  43.33 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1378  putative cysteine dioxygenase, type I  43.33 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1507  cysteine dioxygenase type I family protein  43.33 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  31.25 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  31.25 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  31.25 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  31.78 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  32.54 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  32.54 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  31.21 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  32.54 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  37.07 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  37.07 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  35.34 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  30.92 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  33.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  29.93 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  31.58 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  34.48 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  27.16 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  33.07 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  28.83 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  31.15 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  28.67 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  32 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  32.35 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  32.8 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  30.77 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  30.95 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  27.27 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  27.86 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  33.63 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  26.96 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1987  cysteine dioxygenase type I  31.71 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.935049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2701  hypothetical protein  28.12 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2657  hypothetical protein  32.5 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2415  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2660  hypothetical protein  28.12 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000212284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2667  hypothetical protein  30.83 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2651  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2378  hypothetical protein  27.5 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2453  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00159574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2633  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  30.83 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04081  cysteine dioxygenase Cdo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05570)  29.79 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0171854  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  28.23 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0692  hypothetical protein  58.33 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1178  cysteine dioxygenase type I family protein  58.33 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  30.69 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0030  cysteine dioxygenase type I  31.41 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174778  hitchhiker  0.0000000079419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  30.83 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1493  hypothetical protein  26.43 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  30.51 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>