52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2309 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 173 aa  357  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1987  cysteine dioxygenase type I  36.42 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.935049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  35.66 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  33.77 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  33.77 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1753  cysteine dioxygenase type I  39.53 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1609  cysteine dioxygenase type I  34.09 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  35.88 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  32.7 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  32.7 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  32.7 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  29.56 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  34.85 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  32.82 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  29.07 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2860  cysteine dioxygenase type I family protein  35 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  33.33 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  31.34 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  32 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  37.78 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  36.67 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  30.43 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  28 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  29.85 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  29.73 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  31.3 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  28.95 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1507  cysteine dioxygenase type I family protein  34.17 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1378  putative cysteine dioxygenase, type I  34.17 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1374  putative cysteine dioxygenase, type I  34.17 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  33.58 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  27.68 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  27.68 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  38.89 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  30.38 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  27.63 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  26.09 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  39.56 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  33.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  28.3 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  34.74 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  29.35 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  30.69 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  24.18 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04081  cysteine dioxygenase Cdo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05570)  27.06 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0171854  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  30.77 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  23.03 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  30.23 
 
 		 225 aa  41.2  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  31.5 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>