190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5775 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  68.44 
 
 		 739 aa  960    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 774 aa  1535    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  51.62 
 
 		 555 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  49.53 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  47.33 
 
 		 527 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  45.87 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  47.84 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  44.7 
 
 		 528 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  46.64 
 
 		 532 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  47.84 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  47.83 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  43.91 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 533 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  43.19 
 
 		 527 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  45.25 
 
 		 533 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  44.83 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  45.68 
 
 		 568 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 568 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  44.42 
 
 		 555 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  45.18 
 
 		 527 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  44.85 
 
 		 541 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  42.64 
 
 		 528 aa  359  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.54 
 
 		 539 aa  356  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  44.34 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  44.53 
 
 		 569 aa  350  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  40.58 
 
 		 551 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 529 aa  331  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  41.12 
 
 		 529 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  39.46 
 
 		 931 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  40.42 
 
 		 530 aa  313  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  46.83 
 
 		 411 aa  301  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  40.89 
 
 		 523 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  39.55 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  41.28 
 
 		 548 aa  297  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  39.26 
 
 		 896 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  36.03 
 
 		 526 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  39.39 
 
 		 538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 531 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 380 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.51 
 
 		 361 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  37.57 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  32.07 
 
 		 549 aa  162  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  38.1 
 
 		 223 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  37.91 
 
 		 212 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 226 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  39.51 
 
 		 196 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  38.95 
 
 		 196 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  35.79 
 
 		 196 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  34.39 
 
 		 195 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  37.31 
 
 		 210 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  38.78 
 
 		 200 aa  97.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  37.93 
 
 		 197 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  32.48 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  33.15 
 
 		 208 aa  82  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  30.81 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.1 
 
 		 363 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 248 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 617 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  29 
 
 		 203 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  28.04 
 
 		 203 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  29.2 
 
 		 203 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 470 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  24.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 470 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.82 
 
 		 265 aa  53.5  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.69 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 206 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 		 301 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.59 
 
 		 393 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  27.11 
 
 		 216 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 189 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  23.04 
 
 		 247 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  52  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.85 
 
 		 1240 aa  52.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 102 aa  52  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 211 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 108 aa  51.6  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 466 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  23.45 
 
 		 432 aa  51.2  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37 
 
 		 119 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  25.52 
 
 		 388 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.8 
 
 		 189 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  33.98 
 
 		 201 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 218 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.78 
 
 		 471 aa  48.9  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 		 392 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  27.12 
 
 		 196 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2766  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 209 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  48.5  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.56 
 
 		 132 aa  48.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  34.86 
 
 		 175 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>