130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2410 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
555 aa  1100    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  52.44 
 
 
739 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  51.62 
 
 
774 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  44.42 
 
 
535 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  45.18 
 
 
545 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  44.4 
 
 
549 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 
525 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  44.4 
 
 
549 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  43.61 
 
 
527 aa  365  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  43.61 
 
 
539 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  43.7 
 
 
535 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  44.46 
 
 
541 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  44.28 
 
 
555 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 
528 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  44.1 
 
 
541 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  44.13 
 
 
533 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  44.28 
 
 
569 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.21 
 
 
527 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  43.99 
 
 
568 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  43.99 
 
 
568 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  44.7 
 
 
533 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  45.2 
 
 
569 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
541 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  42.51 
 
 
532 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  41.35 
 
 
551 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  41.54 
 
 
527 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  43.64 
 
 
527 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
528 aa  320  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  40.73 
 
 
529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  40.91 
 
 
530 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  39.33 
 
 
931 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  47.23 
 
 
411 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 
523 aa  296  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  37.52 
 
 
896 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  40.74 
 
 
538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  39.85 
 
 
548 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  33.21 
 
 
526 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  37.57 
 
 
528 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 
531 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  35.65 
 
 
521 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.24 
 
 
361 aa  207  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
380 aa  200  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.96 
 
 
549 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.24 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
470 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
140 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.26 
 
 
141 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
161 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
140 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.41 
 
 
140 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 
141 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.48 
 
 
151 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 
480 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 
472 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  28.11 
 
 
272 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.5 
 
 
471 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.75 
 
 
386 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 
265 aa  50.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 
617 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.92 
 
 
389 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 
114 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.56 
 
 
132 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  25.52 
 
 
457 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
470 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27128  predicted protein  28.18 
 
 
344 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0139269 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29781  predicted protein  28.18 
 
 
344 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000129436 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  27.84 
 
 
99 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
480 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 
392 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
189 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
144 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.54 
 
 
432 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  35.42 
 
 
393 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.08 
 
 
455 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.12 
 
 
142 aa  47.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.04 
 
 
119 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  22.41 
 
 
247 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.67 
 
 
390 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
146 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  26.88 
 
 
99 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 
291 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 
142 aa  47  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  31.19 
 
 
346 aa  47  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>