172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1219 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  65.41 
 
 		 551 aa  679    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 529 aa  1066    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  93.56 
 
 		 529 aa  953    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  62.73 
 
 		 523 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  61.97 
 
 		 528 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  61.79 
 
 		 530 aa  618  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  62.5 
 
 		 531 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  59.81 
 
 		 931 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  57.82 
 
 		 538 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  56.76 
 
 		 896 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  50.28 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 		 526 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  44.36 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  44.36 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  43.91 
 
 		 525 aa  360  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 		 535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  42.66 
 
 		 527 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  41.81 
 
 		 533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.77 
 
 		 527 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  42.47 
 
 		 533 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  42.94 
 
 		 532 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  43.1 
 
 		 739 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  42.06 
 
 		 535 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  42.02 
 
 		 527 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  41.8 
 
 		 528 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  41.12 
 
 		 774 aa  340  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  43.74 
 
 		 527 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  42.48 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  42.13 
 
 		 555 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  43.11 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.62 
 
 		 539 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  43.35 
 
 		 569 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  41.17 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  41.49 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  41.17 
 
 		 569 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  39.17 
 
 		 528 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  40.38 
 
 		 555 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  33.46 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  36.68 
 
 		 361 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  33.27 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  24.75 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28.64 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  25.42 
 
 		 377 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 129 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.51 
 
 		 252 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 137 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.88 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.3 
 
 		 216 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  27.62 
 
 		 220 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  24.15 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  22.29 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.25 
 
 		 124 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 119 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  26.14 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 119 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 461 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 119 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.21 
 
 		 124 aa  53.5  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.1 
 
 		 289 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 140 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  28.87 
 
 		 115 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.97 
 
 		 289 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.56 
 
 		 123 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.01 
 
 		 119 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 480 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  25.38 
 
 		 388 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.02 
 
 		 116 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.83 
 
 		 123 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  31.46 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.66 
 
 		 388 aa  50.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 279 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  32 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.45 
 
 		 159 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 143 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 		 119 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 144 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 140 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.4 
 
 		 562 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 127 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  32.1 
 
 		 135 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>