More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2272 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 406 aa  829    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  32.29 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  29.51 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.99 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 247 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  31.72 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  25.82 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  27.89 
 
 		 230 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  35.45 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 164 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 164 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  32.41 
 
 		 170 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  22.91 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  23.69 
 
 		 931 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  26.02 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  24.15 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  24.36 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  23.74 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 230 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 172 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  25.5 
 
 		 216 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 189 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 		 221 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  29.19 
 
 		 270 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 227 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 274 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 221 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 		 112 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  39.34 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 112 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  24.16 
 
 		 529 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.04 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  23.33 
 
 		 896 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 223 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 147 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  23.33 
 
 		 523 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  26.4 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  32.41 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36 
 
 		 136 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  29.31 
 
 		 152 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.94 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.18 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 221 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 221 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 		 119 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 		 114 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  23.78 
 
 		 535 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.52 
 
 		 189 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  21.91 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  23.43 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 		 466 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 131 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  38.96 
 
 		 197 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  32.82 
 
 		 277 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  28.18 
 
 		 221 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  23 
 
 		 531 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  19.33 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  34.88 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 119 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 173 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  21.84 
 
 		 545 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 119 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 119 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>