135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0555 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  75.58 
 
 		 173 aa  259  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  65.9 
 
 		 173 aa  245  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  65.79 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  52.25 
 
 		 178 aa  187  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  44.97 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  34.33 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 432 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  34.43 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.06 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  30.71 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.58 
 
 		 247 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  30.58 
 
 		 112 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.71 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 		 112 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  27.91 
 
 		 121 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  34.09 
 
 		 123 aa  51.2  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  28.93 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 		 406 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  29.45 
 
 		 423 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  27.69 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  31.85 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0847  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 		 130 aa  47.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  27.84 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.06 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.19 
 
 		 389 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  25.98 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  27.97 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  28.57 
 
 		 101 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  28.83 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  31.68 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  27.5 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 		 126 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 		 480 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  26.19 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  34.33 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 122 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  26.54 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  24.35 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  25.21 
 
 		 101 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  30.84 
 
 		 353 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  29.75 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  37.14 
 
 		 173 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  31.01 
 
 		 300 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  28.79 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.23 
 
 		 123 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  25.95 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  32.18 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  26.23 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 421 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  25.21 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  26.45 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.75 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  30.84 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  29.57 
 
 		 689 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  24.14 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  26.03 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  26.03 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  24.07 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  29.1 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  24.8 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  27.73 
 
 		 101 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  42 
 
 		 438 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  26.28 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>