111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2334 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  100 
 
 		 123 aa  246  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  41.05 
 
 		 401 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  41.54 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 346 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  37.88 
 
 		 356 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  40 
 
 		 355 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  40 
 
 		 355 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  38.81 
 
 		 339 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  37.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.88 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  40 
 
 		 353 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  40.3 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  37.8 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  35.82 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  35.38 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 227 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  32.97 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  32.97 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  47.5 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  36.92 
 
 		 353 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  39.06 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.26 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  36.49 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  35.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  36.51 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.33 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  36.92 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  36.92 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  36.92 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.57 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.89 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  41.79 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  39.71 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  38.71 
 
 		 355 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  43.18 
 
 		 194 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35.06 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  24.8 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  44.74 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2992  rhodanese-like domain-containing protein  36.67 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 		 128 aa  42  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  39.06 
 
 		 221 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  69.23 
 
 		 173 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 269 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  43.55 
 
 		 106 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 258 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 314 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  28.23 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  51.28 
 
 		 293 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.51 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.93 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  34.85 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  37.29 
 
 		 484 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  50 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>