More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0306 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  100 
 
 
293 aa  597  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  72.95 
 
 
291 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  74.11 
 
 
287 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  70.63 
 
 
286 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  68.31 
 
 
298 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  69.97 
 
 
295 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  67.97 
 
 
285 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  62.37 
 
 
300 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  53.9 
 
 
286 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
305 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  33.57 
 
 
291 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 
272 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  34.47 
 
 
287 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.24 
 
 
271 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 
288 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  31.83 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  26.45 
 
 
258 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  32 
 
 
457 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  31.27 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  33.1 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  29.6 
 
 
270 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  27.96 
 
 
272 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
289 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  30 
 
 
280 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  31.14 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  30.38 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  28.16 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  30.07 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  30.07 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 
340 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.97 
 
 
610 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  31.83 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  31.6 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.2 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  29.82 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.8 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  30.18 
 
 
275 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  27.44 
 
 
276 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  29.15 
 
 
290 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  29.54 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  30.99 
 
 
287 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  30.58 
 
 
286 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  33.44 
 
 
282 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  32.16 
 
 
286 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 
291 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  31.27 
 
 
265 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  29.49 
 
 
296 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
301 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 
281 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.11 
 
 
289 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.11 
 
 
289 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  33.11 
 
 
289 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  30.45 
 
 
282 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  30.8 
 
 
272 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  30.24 
 
 
286 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.85 
 
 
289 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 
289 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.67 
 
 
613 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.37 
 
 
277 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  29.66 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  29.21 
 
 
284 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  32.09 
 
 
289 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 
288 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  31.6 
 
 
320 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
366 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  29.37 
 
 
277 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  26.64 
 
 
307 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  27.96 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  29.11 
 
 
281 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.37 
 
 
277 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  29.37 
 
 
277 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  29.93 
 
 
283 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 
277 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 
277 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  29.21 
 
 
277 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  30.33 
 
 
284 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  28.32 
 
 
273 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  28.87 
 
 
281 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.5 
 
 
284 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  31.05 
 
 
335 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  31.42 
 
 
306 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  29.64 
 
 
288 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.74 
 
 
289 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  27.53 
 
 
279 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  29.89 
 
 
435 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>