134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1677 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  64 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  63.22 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  62.58 
 
 		 173 aa  217  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  68.06 
 
 		 173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  42.41 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  35 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.23 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.38 
 
 		 380 aa  57.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.2 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.8 
 
 		 123 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 363 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 258 aa  51.2  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.91 
 
 		 173 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.01 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.25 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  30.08 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  25.83 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.01 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 		 324 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.33 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  27.97 
 
 		 346 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  24.58 
 
 		 129 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  29.85 
 
 		 324 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  36.19 
 
 		 284 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1807  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  37.21 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.71 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 284 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  25.77 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  24.81 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  24 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 301 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 480 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  26.81 
 
 		 241 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  24.8 
 
 		 142 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  27.41 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  38.18 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  28.3 
 
 		 353 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  48.89 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 147 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  31.19 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  26.19 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  30.22 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  29.87 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.91 
 
 		 805 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  26.83 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30 
 
 		 423 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.19 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  28.75 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  26.4 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  35.24 
 
 		 284 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  28.75 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  30.28 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  29.17 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  25.62 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  22.52 
 
 		 276 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  26.95 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  28.23 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  27.14 
 
 		 277 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  28.23 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>