96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4455 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  88.81 
 
 
152 aa  278  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  83.1 
 
 
142 aa  248  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  77.62 
 
 
151 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  78.17 
 
 
142 aa  235  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  75.35 
 
 
142 aa  227  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  67.13 
 
 
146 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  76.86 
 
 
141 aa  203  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  65.03 
 
 
146 aa  203  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  65.49 
 
 
146 aa  202  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  63.64 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  72 
 
 
147 aa  193  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  72 
 
 
147 aa  193  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  71.2 
 
 
147 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  34.51 
 
 
689 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  32.17 
 
 
688 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.01 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  36.23 
 
 
377 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 
90 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.32 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
228 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  28.91 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.43 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  32.67 
 
 
670 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  40 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  32.95 
 
 
363 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  38.33 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  26.75 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  40 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 
406 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  35.9 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  38.98 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.73 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  26.32 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  26.32 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 
432 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  26.87 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.61 
 
 
247 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  27.14 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 
389 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  28.93 
 
 
353 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.58 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  29.89 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  29.89 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  33.03 
 
 
423 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  30.17 
 
 
401 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  32.11 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  26.13 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  28.3 
 
 
301 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 
142 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28.09 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  32.93 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  30.56 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  28.09 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  29.09 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  28.04 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  24.77 
 
 
223 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  25.47 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  26.44 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  29.35 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
226 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  24.55 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  20.59 
 
 
252 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  26.61 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  25.3 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  28.3 
 
 
135 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
110 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 
143 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>