66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0489 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  98.64 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  89.12 
 
 		 147 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  97.28 
 
 		 147 aa  275  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  85.62 
 
 		 146 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  83.56 
 
 		 146 aa  261  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  83.56 
 
 		 146 aa  255  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  73.33 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  65.67 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  65.31 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  63.01 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  63.01 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  59.03 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  62.81 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  45.19 
 
 		 689 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  39.6 
 
 		 688 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  36.63 
 
 		 670 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 363 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  38.03 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  36.99 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.32 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.63 
 
 		 389 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 377 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 454 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  26.25 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  29.89 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.04 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  24.11 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.36 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  31.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  27.68 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  24.82 
 
 		 145 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.17 
 
 		 125 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 135 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 159 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  29.46 
 
 		 1240 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  28.77 
 
 		 406 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 226 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  43.14 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  25.19 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 		 432 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>