76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0490 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  98.64 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  91.16 
 
 
147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  97.28 
 
 
147 aa  275  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  86.99 
 
 
146 aa  270  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  84.93 
 
 
146 aa  262  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  84.93 
 
 
146 aa  257  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  74.17 
 
 
142 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  63.27 
 
 
151 aa  197  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  65.99 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  63.01 
 
 
142 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  63.01 
 
 
142 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  59.86 
 
 
152 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  64.17 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  45.19 
 
 
689 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  39.6 
 
 
688 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  36.63 
 
 
670 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  36 
 
 
363 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  40.28 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  40.54 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.01 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 
389 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  27.5 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  31.88 
 
 
377 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 
178 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
454 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.39 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  24.11 
 
 
252 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.04 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  26.61 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 
173 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 
142 aa  43.5  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  31.03 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  27.59 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
159 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
432 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  31.03 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  26.92 
 
 
235 aa  42.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.36 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.36 
 
 
1240 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.17 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  28.77 
 
 
406 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
179 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.58 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 
171 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  26.79 
 
 
105 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30.77 
 
 
423 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.49 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
222 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  43.14 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 
154 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.78 
 
 
388 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  30.97 
 
 
334 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  31 
 
 
152 aa  40  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  28.72 
 
 
254 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  26.97 
 
 
124 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 
130 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
226 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 
171 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  28.72 
 
 
161 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>