More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0089 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 324 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  94.44 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  31.39 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  31.1 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  30.82 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  29.69 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  31.42 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  29.67 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  31.14 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  28.9 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  30.03 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.11 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  29.35 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  29.35 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  31.27 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  29.47 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.17 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  28.82 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  29.55 
 
 		 277 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  28.52 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  30.15 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.37 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.37 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  27.45 
 
 		 281 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  26.53 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  30.74 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  28.62 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.5 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  29.14 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  28.42 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  27.93 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  26.33 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  28.36 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  27.03 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  25.9 
 
 		 273 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1559  rhodanese domain-containing protein  26.35 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  27.99 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  26.87 
 
 		 285 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  29.2 
 
 		 282 aa  93.2  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  28.97 
 
 		 279 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.1 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  28.33 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  27.42 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  27.85 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  29.26 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  27.95 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  28.91 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  28.08 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  27.87 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  27.8 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  27.15 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  28.69 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  25.96 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  30.28 
 
 		 255 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  30.18 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  28.03 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.78 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  28.12 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  27.21 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.73 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.24 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  24.75 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  28.29 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  31.27 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.29 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  28.29 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.73 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  26.13 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.29 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.29 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>