More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4507 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  100 
 
 
286 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  53.9 
 
 
293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  52.14 
 
 
291 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  51.07 
 
 
287 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  51.06 
 
 
285 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  50.17 
 
 
286 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  49.82 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  49.65 
 
 
295 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  47.31 
 
 
300 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  28.26 
 
 
270 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 
275 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 
291 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 
272 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  31.14 
 
 
324 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  31.14 
 
 
324 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  30.86 
 
 
288 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  25.99 
 
 
258 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  28.36 
 
 
294 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  28.41 
 
 
321 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  28.41 
 
 
321 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.37 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  31.23 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  25.28 
 
 
276 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  26.69 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  28.72 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  26.79 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  29.08 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 
291 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  31.14 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  29.28 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  28.86 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  25.18 
 
 
321 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
321 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 
296 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  25.18 
 
 
276 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 
276 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  28.29 
 
 
321 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  29.86 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.56 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  28.03 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  26.43 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  28.91 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  27.56 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.3 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  29.24 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  29.2 
 
 
665 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 
281 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 
293 aa  89  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  26.96 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  27.17 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1275  Rhodanese domain protein  27.87 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000898965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  25.99 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  28.62 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  27.49 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.49 
 
 
289 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  26.32 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.49 
 
 
289 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  29.49 
 
 
289 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  28.46 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  27.65 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  26.71 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  30.31 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  29.44 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  24.91 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  26.6 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  24.53 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  29.5 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  28.62 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  27.17 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  27 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  28.17 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 
258 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  29.08 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  24.91 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  26.71 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.67 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  26.3 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.57 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  29.67 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.27 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  24.1 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  25.3 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.73 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  27.9 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  27.82 
 
 
297 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  29.84 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>