More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1559 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1559  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  788    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.44 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  30.32 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  27.63 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.74 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  30.46 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  29.94 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.1 
 
 		 271 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  29.94 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  26.84 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.13 
 
 		 610 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  25.81 
 
 		 613 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  27.19 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 		 293 aa  103  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  27.99 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  28.86 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  29.01 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  26.99 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.96 
 
 		 282 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.25 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  26.02 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  26.54 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  24.45 
 
 		 270 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  30.58 
 
 		 285 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  27.38 
 
 		 269 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  27.74 
 
 		 293 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  27.74 
 
 		 293 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  28.07 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  27.66 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  27.76 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  26.8 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  27.91 
 
 		 277 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  28.82 
 
 		 279 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.65 
 
 		 285 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  28.24 
 
 		 289 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  26.97 
 
 		 277 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  25.57 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  29.72 
 
 		 300 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  28.02 
 
 		 290 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  27.99 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  27.22 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  27.19 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  25.08 
 
 		 271 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  27.59 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  26.35 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.5 
 
 		 285 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  26.03 
 
 		 269 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  26.28 
 
 		 277 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  26.96 
 
 		 279 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  27.7 
 
 		 277 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  26.93 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  26.36 
 
 		 289 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  26.93 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  26.93 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  28.05 
 
 		 297 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  27.59 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  27.59 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  25.98 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 		 287 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  26.15 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  26.79 
 
 		 277 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  25.63 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  25.63 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  25.63 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  25.98 
 
 		 277 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.27 
 
 		 286 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.71 
 
 		 285 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  26.84 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  26.13 
 
 		 269 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  23.05 
 
 		 286 aa  89.7  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 		 305 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  25.96 
 
 		 283 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  26.15 
 
 		 286 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  25.63 
 
 		 269 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  26.59 
 
 		 279 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 287 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  26.12 
 
 		 297 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  25.16 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  27.9 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  25.45 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  26.54 
 
 		 301 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  25.36 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  26.06 
 
 		 277 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  26.06 
 
 		 277 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  27.58 
 
 		 275 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  26.84 
 
 		 279 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  23.99 
 
 		 265 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  26.06 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  25.76 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  26.06 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  23.92 
 
 		 281 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 282 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  26.2 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  25.07 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>